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近一个世纪以来，科学家们一直在对人类的基因进行研究，寻找基因结构与人体器官功能之间的关系。科学家们发现，随着人类生活环境的变化，影响人器官功能的基因结构也在改变。这里以人的嗅觉为例，有科学家对人体20至50个不同的染色体区域进行仔细搜寻之后找出了1000个有关嗅觉的基因，这1000个嗅觉基因当中有72％的基因由于经过改变已经丧失了原有的功能，它使得人类的嗅觉远远不及自然界中的很多动物。由于嗅觉已不再是人类求生的重要能力，特别是不会用在寻找食物和辨别掠食动物的足迹和侵袭当中，所以人类的某些嗅觉基因变得没有用武之地，用途退化使得这些基因逐渐失去功能，人类的鼻子因而不象过去那样灵敏。其实，人体器官功能的变化及基因结构改变与环境变化相关这样的例子有很多，随着人类社会的发展，人生存条件和习性的改变，人体各组织和器官都在悄悄地产生着变化，这些变化反映了人生存环境的改变。
在宇宙中，任何物质的存在都要受到其它物质存在的作用和影响，这些作用和影响是导致物质形态变化的原因。对于生物的进化，生物的生存和发展受到环境中各种因素的影响，生物形态的变化与环境状况相关联，并且在不同的环境状况下生物形态变化的趋向是不一样的。
在过去，由于人们对于生物分子的研究还处于初级阶段，对生物体内微观世界所发生的一切知之甚少，尽管人们已经注意到进化过程中必然存在有某些变异，但人们无从知道在微观世界里这些变异是如何发生的，没有人能够证明这些变异产生的原因。生物体与环境中各种存在之间的关系非常复杂，环境中包括了各种有形的和无形的存在，这些存在对于生物体的存在形态的影响是错综复杂的。在生物进化过程中，生物形态的变化表现为生物分子结构对环境中各种存在产生的作用所作出的表达或解释，其中隐含着复杂的物质关联或作用力结构形式。
现代许多科学家认为，细胞的变异、遗传信息的改变应该与环境的变化相关，基因结构变化的推动力来自于生物体与外部环境的作用（生存压力、辐射等等）。在现代分子生物学中，人们逐步能够从分子的层面对变异进行描述，所谓变异应表述为一种与环境变化达成平衡的一种分子结构。在遗传基因内，各种物质按照一定的秩序在空间排列，每个独立的点都表示一定的信息、一个顺序，这种有序的构造用来表述生物体与环境之间关系。对每个生物体而言，它要面对环境的变化，当生物受到的外界作用力发生变化时，此时通过基因分子中某些点的位置和顺序的变动来对应于外部的变化，或者说通过分子结构的变化来对外部变化进行表述和解释。
人们知道，生物体的各组织功能、性状特征以及生物本能是受基因控制的，基因是染色体中脱氧核糖核酸（DNA）大分子中的一个片段，是携带有生命密码信息的物质，这些信息其实反映了生物发展过程中生物体与环境之间的关系。地球上有丰富的物种，微生物、植物、动物都有着自己庞大的家族，这些不同的生命形式之间存在着很大的差异，而这些差异是由生命密码的不同排列组合、结构的大小来决定的。基因是生物细胞内一种活跃的因子，它具有对环境状况做出反映的能力，接受和处理外界信息，通过自身结构的改变来决定是加强还是减弱某种生物功能，而这种改变取决于外界环境所施加的作用力。在生物进化过程中，随着生物由低级向高级的进化，表达生物功能和性状特征的基因结构也在变得越来越复杂，这表明生物分子结构的确有根据环境变化进行改变的能力。
如果对生物体各个组织进行研究就可以有这样的发现，每个组织都有它对应于环境的功用，或者说曾经是有用的（现在正处在退化过程中）。至于生物组织是如何进化的，生物分子结构与环境变化有什么关系，它们通过怎样的分子结构的变换来表述不同的涵义，这是生物学研究的一个课题。在生物与环境的相互关系中，当环境发生变化，生物体内相应的组织结构也会进行调整，这是生物优化适应的过程。不同的环境变化会以不同方式和程度的力作用于生物体，生物组织内的分子受这些力作用时会进行结构的调整，通过这样的调整来适应环境的变化。
对于一个生物体，它的生存过程中会受到各种环境因素的影响，如地理、气候、生存竞争等，即各种生理和心理感受，而这些感受会对生物体的生存形态产生影响，并导致所谓的适应性改变。从这种认识出发，可形成这样定性的结论，即生物分子内部存在一种自控机制，表现为生物优化适应的取向。在生物体与环境的作用过程中，环境的变化就是生物体与环境中各种存在物的作用关系和方式的变化，而生物体会对不同的环境变化作出相对应的反映。在生物体与环境之间的作用关系中，有些因素对生物体的影响起主要作用，而有些起次要作用，这使得人们有可能对生物形态变化的趋向进行判断。
宙物质形态变化依据宇宙物质作用的固有规律，这样的规律是生物进化的基础。从生物进化过程中生物组织和环境变化相对应的关系来看，说生物分子是一种结构的存在不如说是一种模式的存在，即它不是一种固定的构造，而是一种作用力变化的机理，生物形态或结构的变化依据环境中各种作用力的存在状况。生物分子作用力结构变化的趋势与生物的生存环境有关，生物分子根据环境所施加的外力不断进行自身的调整和修正，并且以一定的形态表现出来。观察一下生物体内的各个组织系统（消化、血液循环、神经、免疫等）和器官（耳、眼、鼻、喉等），生物体内不同组织系统和器官的组成物质是不同的，这些组织器官的不同组成结构和物质都是生物在与环境长期作用过程中逐步得到完善的。
因此，对于生物进化我们有必要从环境的影响这方面着手去认识。有关进化的实质问题是：生物体与环境之间是如何作用的，环境变化的信息指令如何作用于生物组织，使生物分子结构作出相应的调整和改变。生物内在机能的调节受到环境变化的影响，如果生物体处于一种稳定的环境中，外界所施加的是一种恒定不变的力，那么生物可以维持现状，不必做出改变。然而，现实的生物都处在一个不断变化的环境之中，自然环境或社会环境，其中充满了竞争和选择。因此，为了适应不断变化的环境，生物必需具备调整自己的能力，而这种调整是生命内在结构的调整。
在生物体内部的优化适应机制的作用下，当环境改变时，生物会自行产生新的变异，这些新的变异与生物所处的环境有关，或者说新的分子结构与外力的作用相平衡。细胞在复制过程中，在外力不变的条件下会复制出完全相同的子细胞，而一旦环境发生变化有可能导致复制出来的子细胞与母细胞不完全相同，即发生了变异，这种状况即使在没有选择的压力下也会发生。在自然界，同样的物种在不同的环境条件下会表现出不同的生长形态，这些条件包括气候、生态、地质状况等等，这些变化不是在选择的压力下产生的，生物体内的分子结构有对应于环境状况自行调节的能力，即由一种平衡转向另一种平衡。
现代一些学者对不同大陆上的古生物化石和现存的生物进行对比研究，他们发现在漫长的进化过程中物种处在一个不断分化的过程中，气候、地理、生物环境的变迁这些都促使一部分生物改变习性，继而改变生理形态，经过漫长时光演化出新的物种。在地球环境的演化过程中，地球的大陆板块在不断运动漂移，同时许多物种也在不断迁徙，这就造成了同一物种后代的长期分离，由于不同的分支处在不同的环境中，经过长期的演化，这些生物就会出现生物形态上的明显差异，如果分离的时间足够的长，甚至会演化成不同的物种，这说明了环境在生物形态变化过程中起重要作用。
因此，对生物进化的研究应着重于生物与环境之间相互作用对于进化的影响，生物在适应环境变化的过程中得以进化。其实，所谓进化可以解释为生物适应变化了的环境，这不同于用生物体内偶然的变异对进化的解释，在偶然性选择选择理论里，进化的发生是完全随机的和不可控制的，这样对生物进化的解释是不够充分的。不可否认，自然选择在进化过程中有着重要作用，但这样的选择是对生物不同个体适应环境状况的选择，这种选择是在进化基础之上的选择。
生物的存在形式和特征是对环境的反映，尽管现在还需对生物分子内部具体变化以及变化的机理做进一步的研究，但人们可以判断生物进化这种现象必定与环境有着不可分割的联系，也就是环境的作用力状况和生物分子的微观变化之间存在联系。生物体的结构和功能是由环境创造出来的，生物能根据环境的变化和需要进行自我调整，环境造就了生物生存的机能和本领。这就好象人造房子，人不仅要进行结构和功能设计，还要进行建筑材料的选择。人造房子是满足生存的需要，生物体内的分子也做着类似的事情，它们所依据的是环境的状况，或者说环境中各种力的作用，采用适当的生物结构和材料来构成生物体的各个组成部分，使生物能适应所处的环境。
在自然发展过程中，生物结构和机能在环境的影响下逐步形成和完善。自然界有色彩、形状、气味、声音等等，相对应的一些生物就有视觉、听觉和嗅觉等等，这些组织是在生物经过长期进化过程中逐步形成和完善的。眼睛用于感应光及色彩，是生物组织对不同波长的光在不同物体表面反射的反应，它具有一种精密的光学构造；耳朵用于感应声音，它的构造符合声学原理，通过对不同声波振动频率的分辨来辨别不同的声音；鼻子用于感觉气味，嗅觉是某种生物组织细胞对化学气体的感应，也就是细胞组织中的化学物质与环境中气体分子之间的化学作用。同时，不同生物组织的物质组成和结构是不一样的，这与这些组织在生物生存中所起的作用有关。对于这一系列的生物器官组织结构和功能，它们的形成和完善是生物分子对应于环境的作用依据自然规律所产生的变化，而这些复杂而有序的生物结构如果仅仅通过偶然性变异来实现和完善是难以想象的。
另外，我们也可以看一下人情感这种存在。人的情感存在和人的社会生活有关，如怜悯心、同情心、羞耻心、内疚感等，这些情感的产生和存在与人类长期的社会文化活动有紧密关联，它们是具有文化属性的生命现象，并由人体内特定的基因结构表达，这些情感的产生和存在与偶然性变异之间没有必然关系，而表现为人类文化生活对人生物形态的影响。同样，用生物机能与环境的对应关系也可以解释生命智慧的产生和存在，过去人们将它归属于神秘的精神范畴的东西，而智力的实质是生物结构对自然界存在规律和法则、物质的不同属性及其相互关系的反映，大脑以特定组成的物质结构而具有了思维功能。在人类的发展过程中，人智力的发展受到社会生产劳动和文化活动的影响，人在认识和改造自然的过程中认知能力不断提高，而人复杂的大脑结构也不能简单地被认为是自然选择的结果。
如果要对生物进化进行完整地表述，生物进化应该是适应环境变化和自然选择共同作用的结果。自生命出现的那一天起，它就具有求生存求发展的内在需求，这种需求表现为生物与环境作用不断演进的过程。这是一个在不断运动和变化的世界，变化是物质的本质特征，任何生物都处在不断变化的环境之中，生物形态变化的趋势总是与环境的变化相吻合。自然界生物的进化首先是生物体自身机能的发展和完善，而自然选择是在生物适应环境基础上的选择，没有物种的自我完善，进化是不可能实现的。
新的进化理论与传统的相比不同在于，在传统的进化理论里，环境对生物进化的影响不是直接的，而是通过偶然性变异和自然选择的结合，这样生命的进化在一定程度上是建立在不确定的基础之上的。而在新的进化理论里，生物进化表现为适应性变化，这就是说生物的存在形态与环境状况之间有着紧密的关联。同时，生物进化不是孤立发生的，生命及其存在体系都在不断发展变化。
从新的进化观念出发，我